Esistono molte implementazioni di Unionfs:

• L'implementazione di www.filesystems.org, si tratta di un modulo kernel che tuttavia non è incluso nel kernel ufficiale. È disponibile per kernel recenti (anche l'ultima 2.6.32) ed è alla sua seconda versione. Debian ha incluso fino alla versione 4 etch il pacchetto unionfs-modules con il relativo unionfs-tools e unionfs-source .
• Aufs